Британская стартап-компания Oxford Nanopore Technologies ускоряет открытие патогенов с помощью своего устройства MinION — портативного недорогого секвенатора ДНК и РНК, работающего в режиме реального времени. MinION подключается к только что представленному портативному суперкомпьютеру с искусственным интеллектом MinIT. MinIT — это аксессуар для быстрого анализа и управления устройствами для секвенирования ДНК нанопор, который поставляется исследователям в области геномики.
Новый портативный суперкомпьютер с искусственным интеллектом на базе NVIDIA AGX способен анализировать последовательность в реальном времени в любом месте. Он предварительно сконфигурирован с помощью программного обеспечения для быстрой настройки и простоты эксплуатации MinION. Карманный MinIT питается от сети или от отдельно приобретаемых аккумуляторных блоков, поэтому его можно использовать как в лабораторных условиях, так и в полевых условиях.
MinIT является идеальным и мощным дополнением к MinION, единственной портативной секвенации ДНК, работающей в режиме реального времени. Он добавил, что по мере того, как потоки данных передаются от наших устройств для секвенирования быстрее, технология графических процессоров, подобная технологии NVIDIA, становится центральной в сохранении свойств нашей технологии секвенирования ДНК в реальном времени. – Гордон Сангера и генеральный директор Oxford Nanopore
Новое устройство, испытанное учеными, помогает бороться с вирусами, уничтожающими урожай. Он в основном используется в Восточной Африке для характеристики патогенов, поражающих растение маниоки. Эксперимент исследователя, проведенный на небольшой ферме в Танзании, позволил охарактеризовать вирусы, вызывающие болезнь маниоки, за 3 коротких часа. Это помогает фермерам получить достаточно важной информации для борьбы с патогенами растений и повышения урожайности сельскохозяйственных культур.
Он также помогает при бортовом анализе морской воды, изучении сообществ морских микроорганизмов. Ученые, стремящиеся понять биоразнообразие океана и то, как изменение климата может повлиять на микроорганизмы в море, с помощью этого суперкомпьютера искусственного интеллекта будут получать данные в режиме реального времени, которые могут храниться недели или месяцы.
MinIT теперь предоставляется ученым, работающим в различных научных дисциплинах. Многие из них работают над приложениями в сфере здравоохранения, такими как быстрая идентификация инфекционных, раковых и других заболеваний. Другие сосредоточены на науках о растениях или окружающей среде или даже на использовании технологий в образовании.
